Megamind zostaje nowym obrońcą Metro City. Swoją działalność rozpoczyna od wyprzedaży gadżetów związanych ze złem. Wszystkie przedmioty znajdują nowych właścicieli – z wyjątkiem jednego. Urządzenie intryguje Megaminda, który w końcu naciska tajemniczy guzik. Nieprzemyślany krok pociąga za sobą nieprzewidziane skutki: w mieście pojawia się Mega-Megamind, w którym znajduje się całe zło jego twórcy. Robot myśli, że Megamind jest Metro Manem i zaczyna go atakować. Kiedy wydaje się, że dla bohatera i jego towarzysza Miniona nie ma już ratunku, nadchodzi nieprzewidziana pomoc.